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蜂蜜是带有弱酸性的液体，因此盛装蜂蜜最好用玻璃瓶、木桶、瓦缸等非金属容器。并用低温储藏，减少变色变味。
 
蜂蜜保存宜放在低温避光处。由于蜂蜜是属于弱酸性的液体，能与金属起化学反应，在贮存过程中接触到铅、锌、铁等金属后，会发生化学反应。因此，应采用非金属容器如陶瓷、玻璃瓶无毒塑料桶等容器来贮存蜂蜜。
 
蜂蜜在贮存过程中还应防止串味、及湿、发酵、污染等。为了避免串味和污染，不得与有异味物品(如汽油、酒精、大蒜等)腐蚀性的物品(如化肥、农药、石灰、碱、硝等)或不卫生的物品(如废品、畜产品等)同储存。
 
蜂蜜的保存期目前国家规定瓶装蜜保质期18个月。但封盖成熟浓度高的蜂也能保质多年。但吃蜂蜜新鲜为好，因新鲜蜜一般色、香、味口感较好。
 
小窍门：用干净的玻璃瓶，按1000克蜂蜜内加生姜两小片的比例，密封存放阴凉处。此法能使蜂蜜久贮不变味。
 
科学研究和实践证明，蜂蜜具有很强的抗菌能力，是世界上唯一不会腐败变质的食品。1913年美国考古学家在埃及金字塔古墓中发现了一坛蜂蜜，经鉴定这坛蜂蜜已历时3300多年，但一点也没有变质，至今还能食用。可见，真正成熟的蜂蜜久置后完全能食用，没有什么严格保质期，但作为食品上市，根据《食品法》都要求在食物商品上标明保质期，因此蜂蜜生产厂家一般把蜂蜜保质期定为2年。
 
但必须指出的是，如果不是成熟的蜂蜜或掺水等劣质产品，这些蜜久置后都会发酵冒泡、变酸、是不能食用的。当然如果发酵不严重的话，在60℃左右水浴加热半个小时处理后还是可以食用的。 总之，不管什么蜂蜜，也无论保存了多久，只要未发生变质，是可以食用的，不会对身体有害。