类风湿关节炎是我国常见风湿病之一。目前类风湿关节炎的病因及发病机理尚未完全明确，若不及时得到有效治疗，致残率高，是老百姓心目中的“大病”。 1987年有人首先报告,吸烟女性发生类风湿关节炎的危险较不吸烟者高2.4倍,此后多项研究证实了该结果。目前,吸烟已被认为是类风湿关节炎的环境危险因素之一。流行病学调查显示,吸烟者中男性类风湿关节炎患病危险高于女性。吸烟量和持续时间都是类风湿关节炎的重要预测因子。吸烟也可能增加类风湿关节炎病人的病情严重程度,如类风湿结节形成、关节破坏、继发肺部病变等。

红斑狼疮有多种不同的病变形式，其中以系统性红斑狼疮为最严重的一种。这是一种难治性疾病，其特点是身体多个组织与器官的感染和破坏。 已有研究显示,吸烟者系统性红斑狼疮发生率显著升高,吸烟量与系统性红斑狼疮危险相关。研究人员对125名红斑狼疮患者与125名年龄与性别配对的健康成年人进行了调查，结果发现现在还在吸烟的人发生红斑狼疮的危险性是非吸烟者的7倍，而以前吸烟的人发生红斑狼疮的危险性是非吸烟者的4倍。戒烟者的患病危险与从不吸烟者无差异。正在吸烟还与系统性红斑狼疮病情严重程度相关。

两项关于女性人群的研究发现,每天吸烟多于15支的女性多发性硬化发病率增高。加拿大的研究显示,既往吸烟者发病率高于从未吸烟者,且每天吸烟20~40支使发病率明显升高。

吸烟已被认为是甲亢病的一个重要而独立的危险因素,尤其与甲亢眼病密切相关,其危险也随戒烟逐渐下降。 研究还显示,吸烟者原发性胆汁性肝硬化危险明显升高。